Der Ursprung des Namens ist wohl nur eingefleischten Fans noch im Hinterkopf. Aus dem Weltall kam ein ungewöhnlich aggressives Mineral auf die Erde, welches sich auf dem Erdboden mit jeglichen Mineralien, die sich im Boden befinden, weiter anreichert. Erstmal aufgetaucht war der Stoff am Tiber (Italien) und so wurde der Name Tiberium geboren. Nach und nach entstanden immer größere Abbaufelder auf der ganzen Welt und durch die einfache Möglichkeit des Erntens wurde nicht darauf Rücksicht genommen, dass das Tiberium für Menschen schon nach kurzer Dauer tödlich sein kann. Immer bessere Erntemaschinen wurden entwickelt, aber nicht nur die Global Defensiv Initiative (GDI) war daran interessiert das Tiberium zu gewinnen, sondern ebenso die dunkle Sekte der Brüderschaft von NOD. Mit dem Gewinn aus der Tiberiumgewinnung überziehen sie die Welt mit schrecklichen Anschlägen, um die Herrschaft an sich zu reißen.

Seither ist Kane der Anführer der NOD und um ihn ranken sich viele Gerüchte und Legenden. Wurde er doch einst beim Einschlag eines Ionenstrahls im Jahr 1999 unter Schuttbergen lebendig begraben, tauchte er 2030 in Tiberian Sun wieder auf und scheint seither nicht tot zu kriegen sein. Eine Legende besagt, er sei unsterblich geworden und tatsächlich ist unklar wie alt Kane wirklich ist. Mittlerweile wird das Jahr 2047 geschrieben, der Kampf zwischen GDI und NOD ist längst nicht beendet und Kane hält weiter an seinen finsteren Welteroberungsplänen fest. Der dritte Tiberiumkrieg hat begonnen und hält zahlreiche Überraschungen bereit, denn GDI und NOD sind nicht die einzigen Parteien in diesem Konflikt.Die Welt steht mittlerweile fast am Abgrund, denn während Kane und die Bruderschaft von NOD weiterhin im Tiberium einen energiereichen Segen sehen, ist die Welt unlängst von den Kristallen in weiten Teilen für immer verseucht. Ein Drittel der Oberfläche ist nicht mehr zu betreten und wird als rote Zone beschrieben. Die gelbe Randzone ermöglicht es Lebensformen unter Umständen zu überleben und nur in der durch GDI kontrollierten blauen Zone ist die Zivilisation zumindest halbwegs normal vital. Auf den Spieler warten actionreiche Zeiten, denn nicht nur GDI und NOD ziehen in den Kampf, sondern ebenso die neue Alien-Rasse der SCRIN. Werden sie am Ende die Lösung dafür sein, wie es dazu kam, dass das Tiberium auf die Welt gelangte? Zunächst steht man vor der Wahl der Seite für die man Partei ergreifen möchte. Als ehrenwerter Kämpfer für die GDI, um die freie Welt zu retten und die Bruderschaft zu bekämpfen oder auf der Seite von NOD und damit als Auslöser der dritten Tiberiumkrieges?